Face ID 和 Touch ID 的用途
解鎖裝置或使用者帳號
若 Face ID 或 Touch ID 已關閉，在裝置或帳號鎖定時，系統會捨棄保留在「安全隔離區」中最高「資料保護」類別的密鑰。除非使用者輸入密碼來解鎖裝置或帳號，否則便無法存取該類別的檔案和鑰匙圈項目。
若 Face ID 或 Touch ID 已開啟，則不會在裝置或帳號鎖定時捨棄這些密鑰，而是透過提供給「安全隔離區」中 Face ID 或 Touch ID 子系統的密鑰進行封裝。使用者嘗試解鎖裝置或帳號時，若裝置偵測到成功的比對，它便會提供密鑰來解除封裝「資料保護」密鑰，裝置或帳號便會解鎖。此流程藉由要求「資料保護」和 Face ID 或 Touch ID 子系統合作來解鎖裝置，因此提供了額外的保護。
當裝置重新開機時，Face ID 或 Touch ID 解鎖裝置或帳號時所需的密鑰會遺失；「安全隔離區」在需要輸入密碼的任何條件滿足時便會捨棄密鑰。
透過 Apple Pay 安全進行購買
Face ID 和 Touch ID 也可以搭配 Apple Pay 使用，方便使用者在商店、App 內和網站上輕鬆且安全地進行購買：
在商店中使用 Face ID：若要使用 Face ID 授權店內付款，使用者必須先按兩下側邊按鈕確認付款意圖，裝置可以透過「按兩下」這種實體手勢來確認使用者意圖，而且此手勢會直接連結到「安全隔離區」，因而可以防止惡意程序進行偽造。使用者接著用 Face ID 進行認證，然後將裝置靠近感應式付款讀卡機。通過 Face ID 認證後可選擇另一種 Apple Pay 付款方式，這需要重新進行認證，不過使用者不用再按兩下側邊按紐。
在 App 內和在網站上使用 Face ID：若要在 App 內和網站上付款，使用者必須先按兩下側邊按鈕確認其付款意圖，然後使用 Face ID 進行認證以授權付款。如果使用者沒有在按兩下側邊按鈕後 60 秒內完成 Apple Pay 交易，就必須再按兩下側邊按鈕重新確認付款意圖。
使用 Touch ID：若為 Touch ID，付款意圖是透過啟用 Touch ID 感測器的手勢並成功比對使用者指紋來完成確認。
使用系統提供的 API
第三方 App 可使用系統提供的 API 來要求使用者透過 Face ID、Touch ID 或密碼進行認證，且支援 Touch ID 的 App 無需任何更動就可自動支援 Face ID。使用 Face ID 或 Touch ID 時，App 只會收到認證是否成功的通知，無法存取 Face ID、Touch ID 或已登記之使用者的相關資料。
保護鑰匙圈項目
Face ID 或 Touch ID 也可用來保護鑰匙圈項目，只有在「安全隔離區」比對成功或是使用裝置密碼或帳號密碼時才將它們釋出。要求以 Face ID、Touch ID 或密碼解鎖鑰匙圈項目前，App 開發者可透過 API 確認使用者已設定密碼。App 開發者可執行以下任何操作：
要求「認證 API」的作業不得改回使用 App 密碼或裝置密碼來當作備用認證方式。他們可以查詢使用者是否已登記，以便允許在對安全性有高度要求的 App 中將 Face ID 或 Touch ID 當作第二個驗證條件。
在「安全隔離區」內產生和使用可由 Face ID 或 Touch ID 保護的橢圓曲線加密技術（ECC）密鑰。「安全隔離區」授權使用這些密鑰後，這些密鑰的相關操作會一律在「安全隔離區」內執行。
購買和核准購買
使用者也可設定 Face ID 或 Touch ID 以用來核准從 iTunes Store、App Store、Apple Books 等服務購買項目，如此一來便無需輸入 Apple ID 密碼。購買後，「安全隔離區」會驗證是否進行了生物辨識認證，然後核發用於簽署儲存要求的 ECC 密鑰。