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Provider: Schloss Dagstuhl - Leibniz Center for Informatics Database: dblp computer science bibliography Content:text/plain; charset="utf-8" TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/MeyerWGLKDW24 AU - Meyer, Lina AU - Woelk, Lena-Marie AU - Gee, Christine E. AU - Lohr, Christian AU - Kannabiran, Sukanya A. AU - Diercks, Björn-Philipp AU - Werner, René TI - Deep Image Prior for Spatio-temporal Fluorescence Microscopy Images DECO-DIP. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2024 - Proceedings, German Conference on Medical Image Computing, Erlangen, March 10-12, 2024 SP - 322 EP - 327 PY - 2024// DO - 10.1007/978-3-658-44037-4_82 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-44037-4_82 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/WallrodtSERSW23 AU - Wallrodt, Moritz AU - Schulz-Alsen, Maximilian AU - Ehlken, Hanno AU - Rösch, Thomas AU - Schmitz, Rüdiger AU - Werner, René TI - Extending Tempcyclegan for Virtual Augmentation of Gastrointestinal Endoscopy Training Simulators. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2023 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Braunschweig, July 2-4, 2023 SP - 3 EP - 8 PY - 2023// DO - 10.1007/978-3-658-41657-7_3 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-41657-7_3 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/HusseiniNPWRW23 AU - Husseini, Hümeyra AU - Nielsen, Maximilian AU - Pantel, Klaus AU - Wikman, Harriet AU - Riethdorf, Sabine AU - Werner, René TI - Label Efficient Classification in Liquid Biopsy Data by Self-supervision. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2023 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Braunschweig, July 2-4, 2023 SP - 261 EP - 266 PY - 2023// DO - 10.1007/978-3-658-41657-7_58 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-41657-7_58 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-2304-05163 AU - Nielsen, Maximilian AU - Wenderoth, Laura AU - Sentker, Thilo AU - Werner, René TI - Self-supervision for medical image classification: state-of-the-art performance with ~100 labeled training samples per class. JO - CoRR VL - abs/2304.05163 PY - 2023// DO - 10.48550/ARXIV.2304.05163 UR - https://doi.org/10.48550/arXiv.2304.05163 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-2305-07152 AU - Zia, Aneeq AU - Bhattacharyya, Kiran AU - Liu, Xi AU - Berniker, Max AU - Wang, Ziheng AU - Nespolo, Rogerio AU - Kondo, Satoshi AU - Kasai, Satoshi AU - Hirasawa, Kousuke AU - Liu, Bo AU - Austin, David AU - Wang, Yiheng AU - Futrega, Michal AU - Puget, Jean-Francois AU - Li, Zhenqiang AU - Sato, Yoichi AU - Fujii, Ryo AU - Hachiuma, Ryo AU - Masuda, Mana AU - Saito, Hideo AU - Wang, An AU - Xu, Mengya AU - Islam, Mobarakol AU - Bai, Long AU - Pang, Winnie AU - Ren, Hongliang AU - Nwoye, Chinedu Innocent AU - Sestini, Luca AU - Padoy, Nicolas AU - Nielsen, Maximilian AU - Schüttler, Samuel AU - Sentker, Thilo AU - Husseini, Hümeyra AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Schmitz, Rüdiger AU - Werner, René AU - Matsun, Aleksandr AU - Farooq, Mugariya AU - Saeed, Numan AU - Viera, Jose Renato Restom AU - Yaqub, Mohammad AU - Getty, Neil AU - Xia, Fangfang AU - Zhao, Zixuan AU - Duan, Xiaotian AU - Yao, Xing AU - Lou, Ange AU - Yang, Hao AU - Han, Jintong AU - Noble, Jack H. AU - Wu, Jie Ying AU - Alshirbaji, Tamer Abdulbaki AU - Jalal, Nour Aldeen AU - Arabian, Herag AU - Ding, Ning AU - Moeller, Knut AU - Chen, Weiliang AU - He, Quan AU - Maier-Hein, Lena AU - Stoyanov, Danail AU - Speidel, Stefanie AU - Jarc, Anthony M. TI - Surgical tool classification and localization: results and methods from the MICCAI 2022 SurgToolLoc challenge. JO - CoRR VL - abs/2305.07152 PY - 2023// DO - 10.48550/ARXIV.2305.07152 UR - https://doi.org/10.48550/arXiv.2305.07152 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/SchuttlerMRWS22 AU - Schüttler, Samuel AU - Madesta, Frederic AU - Rösch, Thomas AU - Werner, René AU - Schmitz, Rüdiger TI - Reinforcement learning-basierte Patchpriorisierung zur beschleunigten Segmentierung von hochauflösenden Endoskopievideodaten. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2022 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Heidelberg, June 26-28, 2022 SP - 339 EP - 344 PY - 2022// DO - 10.1007/978-3-658-36932-3_69 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-36932-3_69 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-2203-06431 AU - Madesta, Frederic AU - Sentker, Thilo AU - Gauer, Tobias AU - Werner, René TI - Deep learning-based conditional inpainting for restoration of artifact-affected 4D CT images. JO - CoRR VL - abs/2203.06431 PY - 2022// DO - 10.48550/ARXIV.2203.06431 UR - https://doi.org/10.48550/arXiv.2203.06431 ER - TY - JOUR ID - DBLP:journals/fini/LiWWXGH21 AU - Li, Dong AU - Wang, Guangyu AU - Werner, René AU - Xie, Hong AU - Guan, Ji-Song AU - Hilgetag, Claus C. TI - Single Image-Based Vignetting Correction for Improving the Consistency of Neural Activity Analysis in 2-Photon Functional Microscopy. JO - Frontiers Neuroinformatics VL - 15 SP - 674439 PY - 2021// DO - 10.3389/FNINF.2021.674439 UR - https://doi.org/10.3389/fninf.2021.674439 UR - https://www.wikidata.org/entity/Q114918733 ER - TY - JOUR ID - DBLP:journals/mia/SchmitzMNKSWR21 AU - Schmitz, Rüdiger AU - Madesta, Frederic AU - Nielsen, Maximilian AU - Krause, Jenny AU - Steurer, Stefan AU - Werner, René AU - Rösch, Thomas TI - Multi-scale fully convolutional neural networks for histopathology image segmentation: From nuclear aberrations to the global tissue architecture. JO - Medical Image Anal. VL - 70 SP - 101996 PY - 2021// DO - 10.1016/J.MEDIA.2021.101996 UR - https://doi.org/10.1016/j.media.2021.101996 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/MadestaSRW21 AU - Madesta, Frederic AU - Schmitz, Rüdiger AU - Rösch, Thomas AU - Werner, René TI - Abstract: Widening the Focus - Biomedical Image Segmentation Challenges and the Underestimated Role of Patch Sampling and Inference Strategies. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2021 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Regensburg, March 7-9, 2021 SP - 253 PY - 2021// DO - 10.1007/978-3-658-33198-6_58 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-33198-6_58 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/NielsenWSFFW21 AU - Nielsen, Maximilian AU - Waldmann, Moritz AU - Sentker, Thilo AU - Frölich, Andreas AU - Fiehler, Jens AU - Werner, René TI - Abstract: Time Matters - Handling Spatio-temporal Perfusion Information for Automated Treatment in Cerebral Ischemia Scoring. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2021 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Regensburg, March 7-9, 2021 SP - 297 PY - 2021// DO - 10.1007/978-3-658-33198-6_72 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-33198-6_72 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/BaltruschatSGGW21 AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Szwargulski, Patryk AU - Griese, Florian AU - Grosser, Mirco AU - Werner, René AU - Knopp, Tobias TI - Abstract: Reduktion der Kalibrierungszeit für die Magnetpartikelbildgebung mittels Deep Learning. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2021 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Regensburg, March 7-9, 2021 SP - 337 PY - 2021// DO - 10.1007/978-3-658-33198-6_82 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-33198-6_82 ER - TY - JOUR ID - DBLP:journals/tbe/GessertSMSKBWS20 AU - Gessert, Nils AU - Sentker, Thilo AU - Madesta, Frederic AU - Schmitz, Rüdiger AU - Kniep, Helge AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Werner, René AU - Schlaefer, Alexander TI - Skin Lesion Classification Using CNNs With Patch-Based Attention and Diagnosis-Guided Loss Weighting. JO - IEEE Trans. Biomed. Eng. VL - 67 IS - 2 SP - 495 EP - 503 PY - 2020// DO - 10.1109/TBME.2019.2915839 UR - https://doi.org/10.1109/TBME.2019.2915839 UR - https://www.wikidata.org/entity/Q91882156 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/isbi/HadaeghiDWW20 AU - Hadaeghi, Fatemeh AU - Diercks, Björn-Philipp AU - Wolf, Insa M. A. AU - Werner, René TI - Reservoir Computing for Jurkat T-cell Segmentation in High Resolution Live Cell Ca²+ Fluorescence Microscopy. BT - 17th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, ISBI 2020, Iowa City, IA, USA, April 3-7, 2020 SP - 1587 EP - 1591 PY - 2020// DO - 10.1109/ISBI45749.2020.9098464 UR - https://doi.org/10.1109/ISBI45749.2020.9098464 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miccai/BaltruschatSGGW20 AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Szwargulski, Patryk AU - Griese, Florian AU - Grosser, Mirco AU - Werner, René AU - Knopp, Tobias TI - 3d-SMRnet: Achieving a New Quality of MPI System Matrix Recovery by Deep Learning. BT - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2020 - 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4-8, 2020, Proceedings, Part II SP - 74 EP - 82 PY - 2020// DO - 10.1007/978-3-030-59713-9_8 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-030-59713-9_8 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miccai/NielsenWSFFW20 AU - Nielsen, Maximilian AU - Waldmann, Moritz AU - Sentker, Thilo AU - Frölich, Andreas AU - Fiehler, Jens AU - Werner, René TI - Time Matters: Handling Spatio-Temporal Perfusion Information for Automated TICI Scoring. BT - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2020 - 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4-8, 2020, Proceedings, Part VI SP - 86 EP - 96 PY - 2020// DO - 10.1007/978-3-030-59725-2_9 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-030-59725-2_9 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miccai/MadestaSRW20 AU - Madesta, Frederic AU - Schmitz, Rüdiger AU - Rösch, Thomas AU - Werner, René TI - Widening the Focus: Biomedical Image Segmentation Challenges and the Underestimated Role of Patch Sampling and Inference Strategies. BT - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2020 - 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4-8, 2020, Proceedings, Part IV SP - 289 EP - 298 PY - 2020// DO - 10.1007/978-3-030-59719-1_29 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-030-59719-1_29 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/NielsenWFFW19 AU - Nielsen, Maximilian AU - Waldmann, Moritz AU - Frölich, Andreas AU - Fiehler, Jens AU - Werner, René TI - Machbarkeitsstudie zur CNN-basierten Identifikation und TICI-Klassifizierung zerebraler ischämischer Infarkte in DSA-Daten. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2019 - Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 17. bis 19. März 2019 in Lübeck SP - 200 EP - 205 PY - 2019// DO - 10.1007/978-3-658-25326-4_45 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-658-25326-4_45 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/mibam/WernerWSMK19 AU - Werner, René AU - Weller, Dominik AU - Salamon, Johannes M. 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BT - Medical Imaging 2019: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling, San Diego, CA, USA, 16-21 February 2019 SP - 1095109 PY - 2019// DO - 10.1117/12.2512423 UR - https://doi.org/10.1117/12.2512423 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miip/MadestaGSW19 AU - Madesta, Frederic AU - Gauer, Tobias AU - Sentker, Thilo AU - Werner, René TI - Self-consistent deep learning-based boosting of 4D cone-beam computed tomography reconstruction. BT - Medical Imaging 2019: Image Processing, San Diego, California, United States, 16-21 February 2019 SP - 1094902 PY - 2019// DO - 10.1117/12.2512980 UR - https://doi.org/10.1117/12.2512980 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-1905-02793 AU - Gessert, Nils AU - Sentker, Thilo AU - Madesta, Frederic AU - Schmitz, Rüdiger AU - Kniep, Helge AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Werner, René AU - Schlaefer, Alexander TI - Skin Lesion Classification Using CNNs with Patch-Based Attention and Diagnosis-Guided Loss Weighting. 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JO - CoRR VL - abs/1909.10726 PY - 2019// UR - http://arxiv.org/abs/1909.10726 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-1910-03910 AU - Gessert, Nils AU - Nielsen, Maximilian AU - Shaikh, Mohsin AU - Werner, René AU - Schlaefer, Alexander TI - Skin Lesion Classification Using Ensembles of Multi-Resolution EfficientNets with Meta Data. JO - CoRR VL - abs/1910.03910 PY - 2019// UR - http://arxiv.org/abs/1910.03910 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/MogadasSW18 AU - Mogadas, Nik AU - Sothmann, Thilo AU - Werner, René TI - Einfluss nicht-rigider Bildregistrierung auf 4D-Dosissimulation bei extrakranieller SBRT. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2018 - Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. 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BT - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI 2018 - 21st International Conference, Granada, Spain, September 16-20, 2018, Proceedings, Part I SP - 765 EP - 773 PY - 2018// DO - 10.1007/978-3-030-00928-1_86 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-030-00928-1_86 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miigp/SothmannGW18 AU - Sothmann, Thilo AU - Gauer, Tobias AU - Werner, René TI - Influence of 4D CT motion artifacts on correspondence model-based 4D dose accumulation. BT - Medical Imaging 2018: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling, Houston, Texas, United States, 10-15 February 2018 SP - 105760F PY - 2018// DO - 10.1117/12.2291481 UR - https://doi.org/10.1117/12.2291481 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miip/MuckeHW18 AU - Mücke, Eike AU - Handels, Heinz AU - Werner, René TI - Self-reference-based and during-registration detection of motion artifacts in spatio-temporal image data. BT - Medical Imaging 2018: Image Processing, Houston, Texas, United States, 10-15 February 2018 SP - 105740Q PY - 2018// DO - 10.1117/12.2293068 UR - https://doi.org/10.1117/12.2293068 ER - TY - Informal or Other Publication ID - DBLP:journals/corr/abs-1808-01694 AU - Gessert, Nils AU - Sentker, Thilo AU - Madesta, Frederic AU - Schmitz, Rüdiger AU - Kniep, Helge AU - Baltruschat, Ivo M. AU - Werner, René AU - Schlaefer, Alexander TI - Skin Lesion Diagnosis using Ensembles, Unscaled Multi-Crop Evaluation and Loss Weighting. JO - CoRR VL - abs/1808.01694 PY - 2018// UR - http://arxiv.org/abs/1808.01694 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/WernerSSMWCF17 AU - Werner, René AU - Schetelig, Daniel AU - Sothmann, Thilo AU - Mücke, Eike AU - Wilms, Matthias AU - Cheng, Bastian AU - Forkert, Nils Daniel TI - Low Rank and Sparse Matrix Decomposition as Stroke Segmentation Prior: Useful or Not? A Random Forest-Based Evaluation Study. 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A. AU - Guse, Andreas H. AU - Schlaefer, Alexander TI - Systematic Analysis of Jurkat T-Cell Deformation in Fluorescence Microscopy Data. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2017 - Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 12. bis 14. März 2017 in Heidelberg SP - 275 EP - 280 PY - 2017// DO - 10.1007/978-3-662-54345-0_63 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-662-54345-0_63 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/bildmed/WernerJHSWSKTWM16 AU - Werner, Franziska AU - Jung, Caroline AU - Hofmann, Martin AU - Salamon, Johannes AU - Werner, René AU - Säring, Dennis AU - Kaul, Michael G. AU - Them, Kolja AU - Weber, Oliver M. AU - Mummert, Tobias AU - Adam, Gerhard AU - Ittrich, Harald AU - Knopp, Tobias TI - Geometrieplanung und Bildregistrierung mittels bimodaler Fiducial-Marker für Magnetic Particle Imaging. BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2016 - Algorithmen - Systeme - Anwendungen, Proceedings des Workshops vom 13. bis 15. 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BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 15. bis 17. März 2015 in Lübeck SP - 401 EP - 406 PY - 2015// DO - 10.1007/978-3-662-46224-9_69 UR - https://doi.org/10.1007/978-3-662-46224-9_69 ER - TY - CPAPER ID - DBLP:conf/miip/WernerG15 AU - Werner, René AU - Gauer, Tobias TI - Reference geometry-based detection of (4D-)CT motion artifacts: a feasibility study. BT - Medical Imaging 2015: Image Processing, Orlando, Florida, USA, February 24-26, 2015 SP - 94130S PY - 2015// DO - 10.1117/12.2075853 UR - https://doi.org/10.1117/12.2075853 ER - TY - JOUR ID - DBLP:journals/cars/MarxEWSH14 AU - Marx, Mirko AU - Ehrhardt, Jan AU - Werner, René AU - Schlemmer, Heinz-Peter AU - Handels, Heinz TI - Simulation of spatiotemporal CT data sets using a 4D MRI-based lung motion model. JO - Int. J. Comput. Assist. Radiol. Surg. 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