Marco Saligari commence sa carrière professionnelle en 1987 chez Ceramiche Ariostea. Il reste dans cette équipe pendant sept saisons et y remporte ses principales victoires : le Tour de Suisse1993 et deux étapes du Tour d'Italie, l'une en 1992, l'autre en 1993. En 1994, il s'engage avec la formation MG Maglificio. Il y gagne notamment une nouvelle étape du Giro. Il effectue ses deux dernières saisons de coureur professionnel au sein de l'équipe françaiseCasino. Il signe son dernier succès en février 1998 au Grand Prix d'ouverture La Marseillaise, lançant une saison prolifique pour Casino.Surnommé « Il Commisario » (le Commissaire) en raison de sa compréhension de la course et de sa capacité à diriger son équipe, il a intégré l'encadrement de l'équipe belgeLandbouwkrediet en tant que directeur sportif en 2002[1].