EC 3.5

Le groupe EC3.5 rassemble des enzymes appartenant à la famille des hydrolases. Elles ont pour particularité de catalyser des réactions d'hydrolyse dans des molécules possédant un carbone et un azote liés par liaison simple, double ou triple.

À la différence des peptidases (groupe EC3.4), ces enzymes n'interviennent pas sur les liaisons peptidiques mais sur les groupements attachés à un atome d'azote non peptidique ou sur des bases nucléotidiques. Elles jouent un rôle principalement dans la régulation de la biosynthèse des protéines et dans le métabolisme de certains acides aminés.

On les divise en quatre groupes.

• Les amidases, qui coupent au niveau d'un groupe amide suivant la réaction

R-CO-NH-R' + H₂O ⇌ R-COOH + R'-NH₂

• Les déiminases qui catalysent les réactions

R-C(=NH)-NH₂ + H₂O  $\rightleftharpoons$  R-H + NH₂-CO-NH₂
ou R-C(=NH)-NH₂ + H₂O  $\rightleftharpoons$  R-CH(-NH₂)-COOH + NH₃

• Les désaminases qui catalysent la réaction

R-C(-NH₂)=NH-R' + H₂O  $\rightleftharpoons$  R-CO-NH-R' + NH₃

• Les nitrilases qui catalysent la réaction

R-C≡N + 2 H₂O  $\rightleftharpoons$  R-COOH + NH₃

Classification des enzymes du groupe EC3.5

EC 3.5.1 : Enzymes spécifiques des amides linéaires (liaison C-N linéaire)

Liste des enzymes du groupe EC3.5.1

• EC 3.5.1.1 : asparaginase
• EC 3.5.1.2 : glutaminase
• EC 3.5.1.3 : ω-amidase
• EC 3.5.1.4 : amidase
• EC 3.5.1.5 : uréase
• EC 3.5.1.6 : β-uréidopropionase
• EC 3.5.1.7 : ureidosuccinase
• EC 3.5.1.8 : formylaspartate-déformylase
• EC 3.5.1.9 : arylformamidase
• EC 3.5.1.10 : formyltétrahydrofolate-déformylase
• EC 3.5.1.11 : pénicilline-amidase
• EC 3.5.1.12 : biotinidase
• EC 3.5.1.13 : aryl-acylamidase
• EC 3.5.1.14 : aminoacylase
• EC 3.5.1.15 : aspartoacylase
• EC 3.5.1.16 : acétylornithine-déacétylase
• EC 3.5.1.17 : acyl-lysine-déacylase
• EC 3.5.1.18 : succinyl-diaminopimélate-désuccinylase
• EC 3.5.1.19 : nicotinamidase
• EC 3.5.1.20 : citrullinase
• EC 3.5.1.21 : N-acétyl-β-alanine-déacétylase
• EC 3.5.1.22 : pantothénase
• EC 3.5.1.23 : céramidase
• EC 3.5.1.24 : choloylglycine-hydrolase
• EC 3.5.1.25 : N-acétylglucosamine-6-phosphate-déacétylase
• EC 3.5.1.26 : N4-(β-N-acétylglucosaminyl)-L-asparaginase
• EC 3.5.1.27 : N-formylméthionylaminoacyl-ARNt-déformylase
• EC 3.5.1.28 : N-acétylmuramoyl-L-alanine-amidase
• EC 3.5.1.29 : 2-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
• EC 3.5.1.30 : 5-aminopentanamidase
• EC 3.5.1.31 : formylméthionine-déformylase
• EC 3.5.1.32 : hippurate-hydrolase
• EC 3.5.1.33 : N-acétylglucosamine-déacétylase
• EC 3.5.1.34 : supprimée (transférée vers EC 3.4.13.5)
• EC 3.5.1.35 : D-glutaminase
• EC 3.5.1.36 : N-méthyl-2-oxoglutaramate-hydrolase
• EC 3.5.1.37 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.26)
• EC 3.5.1.38 : glutamine-asparaginase
• EC 3.5.1.39 : alkylamidase
• EC 3.5.1.40 : acylagmatine-amidase
• EC 3.5.1.41 : chitine-déacétylase
• EC 3.5.1.42 : nicotinamide-nucléotide-amidase
• EC 3.5.1.43 : peptidyl-glutaminase
• EC 3.5.1.44 : protéine-glutamine-glutaminase
• EC 3.5.1.45 : transférée vers EC 6.3.4.6
• EC 3.5.1.46 : 6-aminohexanoate-dimère-hydrolase
• EC 3.5.1.47 : N-acétyldiaminopimélate-déacétylase
• EC 3.5.1.48 : acétylspermidine-déacétylase
• EC 3.5.1.49 : formamidase
• EC 3.5.1.50 : pentanamidase
• EC 3.5.1.51 : 4-acétamidobutyryl-CoA-déacétylase
• EC 3.5.1.52 : peptide-N4-(N-acétyl-β-glucosaminyl)asparagine-amidase
• EC 3.5.1.53 : N-carbamoylputrescine-amidase
• EC 3.5.1.54 : allophanate-hydrolase
• EC 3.5.1.55 : acide gras à longue chaîne-glutamate-déacylase
• EC 3.5.1.56 : N,N-diméthylformamidase
• EC 3.5.1.57 : tryptophanamidase
• EC 3.5.1.58 : N-benzyloxycarbonylglycine-hydrolase
• EC 3.5.1.59 : N-carbamoylsarcosine-amidase
• EC 3.5.1.60 : N-acyléthanolamine à longue chaîne-déacylase
• EC 3.5.1.61 : mimosinase
• EC 3.5.1.62 : acétylputrescine-déacétylase
• EC 3.5.1.63 : 4-acétamidobutyrate-déacétylase
• EC 3.5.1.64 : Nα-benzyloxycarbonylleucine-hydrolase
• EC 3.5.1.65 : théanine-hydrolase
• EC 3.5.1.66 : 2-(hydroxyméthyl)-3-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
• EC 3.5.1.67 : 4-méthylèneglutaminase
• EC 3.5.1.68 : N-formylglutamate-déformylase
• EC 3.5.1.69 : glycosphingolipide-déacylase
• EC 3.5.1.70 : aculéacine A-déacylase
• EC 3.5.1.71 : N-féruloylglycine-déacylase
• EC 3.5.1.72 : D-benzoylarginine-4-nitroanilide-amidase
• EC 3.5.1.73 : carnitinamidase
• EC 3.5.1.74 : chénodésoxycholoyltaurine-hydrolase
• EC 3.5.1.75 : uréthanase
• EC 3.5.1.76 : arylalkyl-acylamidase
• EC 3.5.1.77 : N-carbamoyl-D-aminoacide-hydrolase
• EC 3.5.1.78 : glutathionylspermidine-amidase
• EC 3.5.1.79 : phthalyl-amidase
• EC 3.5.1.80 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.25)
• EC 3.5.1.81 : N-acyl-D-aminoacide-déacylase
• EC 3.5.1.82 : N-acyl-D-glutamate-déacylase
• EC 3.5.1.83 : N-acyl-D-aspartate-déacylase
• EC 3.5.1.84 : biuret-amidohydrolase
• EC 3.5.1.85 : (S)-N-acétyl-1-phényléthylamine-hydrolase
• EC 3.5.1.86 : mandélamide-amidase
• EC 3.5.1.87 : N-carbamoyl-L-aminoacide-hydrolase
• EC 3.5.1.88 : peptide-déformylase
• EC 3.5.1.89 : N-acétylglucosaminylphosphatidylinositol-déacétylase
• EC 3.5.1.90 : adénosylcobinamide-hydrolase
• EC 3.5.1.91 : formamide N-substituée-déformylase
• EC 3.5.1.92 : pantéthéine-hydrolase
• EC 3.5.1.93 : acide glutaryl-7-aminocéphalosporanique-acylase
• EC 3.5.1.94 : γ-glutamyl-γ-aminobutyrate-hydrolase
• EC 3.5.1.95 : N-malonylurée-hydrolase
• EC 3.5.1.96 : succinylglutamate-désuccinylase
• EC 3.5.1.97 : acyl-homosérine-lactone-acylase
• EC 3.5.1.98 : histone-déacétylase
• EC 3.5.1.99 : amide d'acide gras-hydrolase
• EC 3.5.1.100 : (R)-amidase
• EC 3.5.1.101 : L-prolinamide-hydrolase

 

EC 3.5.2 : Enzymes spécifiques des amides cycliques (liaison C-N cyclique)

Liste des enzymes du groupe EC3.5.2

• EC 3.5.2.1 : barbiturase
• EC 3.5.2.2 : dihydropyrimidinase
• EC 3.5.2.3 : dihydroorotase
• EC 3.5.2.4 : carboxyméthylhydantoïnase
• EC 3.5.2.5 : allantoïnase
• EC 3.5.2.6 : β-lactamase
• EC 3.5.2.7 : imidazolonepropionase
• EC 3.5.2.8 : supprimée (incluse dans EC 3.5.2.6)
• EC 3.5.2.9 : 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysante)
• EC 3.5.2.10 : créatininase
• EC 3.5.2.11 : L-lysine-lactamase
• EC 3.5.2.12 : 6-aminohexanoate-dimère cyclique-hydrolase
• EC 3.5.2.13 : 2,5-dioxopipérazine-hydrolase
• EC 3.5.2.14 : N-méthylhydantoïnase (ATP-hydrolysante)
• EC 3.5.2.15 : acide cyanurique-amidohydrolase
• EC 3.5.2.16 : maléimide-hydrolase
• EC 3.5.2.17 : hydroxyisourate-hydrolase
• EC 3.5.2.18 : énamidase

 

EC 3.5.3 : Déiminases (enzymes spécifiques des amidines linéaires) (liaison C=N linéaire)

Liste des enzymes du groupe EC3.5.3

• EC 3.5.3.1 : arginase
• EC 3.5.3.2 : guanidinoacétase
• EC 3.5.3.3 : créatinase
• EC 3.5.3.4 : allantoïcase
• EC 3.5.3.5 : formiminoaspartate-déiminase
• EC 3.5.3.6 : arginine-déiminase
• EC 3.5.3.7 : guanidinobutyrase
• EC 3.5.3.8 : formimidoylglutamase
• EC 3.5.3.9 : allantoate-déiminase
• EC 3.5.3.10 : D-arginase
• EC 3.5.3.11 : agmatinase
• EC 3.5.3.12 : agmatine-déiminase
• EC 3.5.3.13 : formiminoglutamate-déiminase
• EC 3.5.3.14 : amidinoaspartase
• EC 3.5.3.15 : protéine-arginine-déiminase
• EC 3.5.3.16 : méthylguanidinase
• EC 3.5.3.17 : guanidinopropionase
• EC 3.5.3.18 : diméthylargininase
• EC 3.5.3.19 : uréidoglycolate-hydrolase
• EC 3.5.3.20 : diguanidinobutanase
• EC 3.5.3.21 : méthylènediurée-désaminase
• EC 3.5.3.22 : proclavaminate-amidinohydrolase
• EC 3.5.3.23 : N-succinylarginine-dihydrolase

 

EC 3.5.4 : Enzymes spécifiques des amidines cycliques (liaison C=N cyclique)

Liste des enzymes du groupe EC3.5.4

• EC 3.5.4.1 : cytosine-désaminase
• EC 3.5.4.2 : adénine-désaminase
• EC 3.5.4.3 : guanine-désaminase
• EC 3.5.4.4 : adénosine désaminase
• EC 3.5.4.5 : cytidine-désaminase
• EC 3.5.4.6 : AMP-désaminase
• EC 3.5.4.7 : ADP-désaminase
• EC 3.5.4.8 : aminoimidazolase
• EC 3.5.4.9 : méthényltétrahydrofolate-cyclohydrolase
• EC 3.5.4.10 : IMP-cyclohydrolase
• EC 3.5.4.11 : ptérine-désaminase
• EC 3.5.4.12 : dCMP-désaminase
• EC 3.5.4.13 : dCTP-désaminase
• EC 3.5.4.14 : désoxycytidine-désaminase
• EC 3.5.4.15 : guanosine-désaminase
• EC 3.5.4.16 : GTP-cyclohydrolase I
• EC 3.5.4.17 : adénosine-phosphate-désaminase
• EC 3.5.4.18 : ATP-désaminase
• EC 3.5.4.19 : phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase
• EC 3.5.4.20 : pyrithiamine-désaminase
• EC 3.5.4.21 : créatinine-désaminase
• EC 3.5.4.22 : 1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate-désaminase
• EC 3.5.4.23 : blasticidine S-désaminase
• EC 3.5.4.24 : sépiaptérine-désaminase
• EC 3.5.4.25 : GTP-cyclohydrolase II
• EC 3.5.4.26 : diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-désaminase
• EC 3.5.4.27 : méthényltétrahydrométhanoptérine-cyclohydrolase
• EC 3.5.4.28 : S-adénosylhomocystéine-désaminase
• EC 3.5.4.29 : GTP-cyclohydrolase IIa
• EC 3.5.4.30 : dCTP-désaminase (formatrice de dUMP)

 

EC 3.5.5 : Nitrilases (enzymes spécifiques des nitriles) (liaison C≡N)

Liste des enzymes du groupe EC3.5.5

• EC 3.5.5.1 : nitrilase
• EC 3.5.5.2 : ricinine-nitrilase
• EC 3.5.5.3 : transférée vers EC 4.3.99.1
• EC 3.5.5.4 : cyanoalanine-nitrilase
• EC 3.5.5.5 : arylacétonitrilase
• EC 3.5.5.6 : bromoxynil-nitrilase
• EC 3.5.5.7 : nitrilase aliphatique
• EC 3.5.5.8 : thiocyanate-hydrolase

 

EC 3.5.99 : Autres enzymes

Liste des enzymes du groupe EC3.5.99

• EC 3.5.99.1 : riboflavinase
• EC 3.5.99.2 : thiaminase
• EC 3.5.99.3 : hydroxydéchloroatrazine-éthylaminohydrolase
• EC 3.5.99.4 : N-isopropylammélide-isopropylaminohydrolase
• EC 3.5.99.5 : 2-aminomuconate-désaminase
• EC 3.5.99.6 : glucosamine-6-phosphate-désaminase
• EC 3.5.99.7 : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-désaminase

 

Références

• Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology