Jakoba
| Jakoba (Rod u taksonu Excavata) | |
|---|---|
 Četiri jakobidne vrste, sa utorima i bičevima: Jakoba libera (ventralo), Stygiella incarcerata (ventralno), Reclinomonas americana (dorzalno) i Histiona aroides (vanjski izgled) | |
| Sistematika | |
| Domena | Eukarioti |
| Razred | Jakobea |
| Red | Jakobida |
| Porodica | Jakobidae Patterson 1990 |
| Rod | Jakoba Patterson 1990 |
| Vrste | |
| |
| Sinonimi | |
| |
Jakoba je rod u taksonu Excavata[1] i ima samo jednu opisanu vrstu, Jakoba libera. (Ranije opisana Jakoba incarcerata preimenovano je u Andalucia incarcerata, a Jakoba bahamensis/Jakoba bahamiensis nije formalno opisana).[2]
Opis
[uredi | uredi izvor]Jakoba je mala bakterivorna morska zooflagellata (jakobid),[3] nađena i u hipersalinskom okruženju.[2]. One su slobodne plivajuće trofičke ćelije s dva biča i dužine između pet i deset mikrometara. Okreću se duž svoje uzdužne osi kako bi omogućile plivanje u pravim linijama [3] osim ako se zbog kompresije u krhotinama ne dogodi deformacija i „škljocanje“. Za vrijeme hranjenja, bakterije se izlaze iz vodenog stuba strujom koju stvara zadnji bič. Ova struja uzrokuje da se bakterije sakupe u brazdi [4] on the right ventral side of the cell [3] – pomažući u gutanju i stvaranju hranjive vakuole.[4]
Ultrastrultura
[uredi | uredi izvor]Ćelijske komponente kod Jakoba nisu naročito jedinstvene. Sadrže jedno jedro koje se nalazi u blizini baze biča, jedno Golgijevo tijelo, a mitohondrijske organele su spljoštene.
Međutim, mitohondrije kod Jakoba posebno su evolucijski zanimljive zbog jedinstvene bakteriolikosti – poput mitohondrijskog genoma. Utvrđeno je da njihovi mitohondrijski genomi sadrže znatno više funkcionalnih gena drugih eukariotskih grupa i čini se da su zadržali eubakterijsku predačku RNK polimerazu, koja je zamijenjena polimerazom virusa tipa u svim ostalim mitohondrijskim eukariotima. Sve u svemu, jakobidni mitohondrijski genomi su primitivno složeni po tome što više nalikuju svojim proteobakterijskim precima nego što je to kod bilo kojih drugih mitohondrija.[5]
Životni ciklus
[uredi | uredi izvor]Jakobe karakterizira aseksualna reprodukcija putem binarne fisije. Nije primijećena spolna reprodukcija ili stvaranje cista.[3]
Molekulske sekvence
[uredi | uredi izvor]Kružni mitohondrijski genom Jakoba libera ATCC 50422 veličine je 96.6 kbp. Sekvenciranje je gotovo završeno. Dosad je identificirano 77 gena, od kojih nijedan nije uključivao intron. Intergenične regije čine ~ 30% genoma i sadrže nakupine tandemskih ponavljanja čija je jedinična dužina ~ 20 bp. Transkribirani geni nalaze se na oba lanca nukleotida u DNK. Za translaciju koristi se standardni genetički kod.
Enkodirani geni uključuju one koji se obično nalaze u mtDNK, uključujući gene koji kodiraju proteine iznad 1,2,2,4,4L, 5,6, cob, cox1,2,3 i atp 6,8,9. kao velike podjedinice (rnl) i male podjedinice (rns) rRNK geni i >22 gema za tRNK. Prisutni su i brojni proteinski geni tipski za protist, ali ne i životinjske ili gljivične mtDNK. Oni uključuju nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 i rps2-4,11-14,19. Mnogo jedinstvenih ORF-ova je također kodirano s mtDNK u J. libera.
Nekolikomitohondrijskih gena J. libera su rijetki ili ih nema u drugim mitohondrijskim genima, ali su prisutni u bakterijama. Među tim rijetkim ili jedinstvenim kodirajućim mtDNK genima su dpo, rpoB, C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W i nekoliko gena ribosomskog proteina.
Poređenje sekvenci gena u mtDNK J. libera pokazuje klastere koji se inače ne nalaze u bakterijama, ali koji su se očito pojavili tokom evolucije mitohondrijskog genoma, nakon divergencije protomitohondrija iz bakterijske loze. Primjeri su klasteri dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W.[6]
Kulture
[uredi | uredi izvor]Danas su dostupne tri kultivirane linije „Jakoba libera“. Ne mogu se uzgajati posebno, već se lahko uzgajaju u minimalnom mediju s dodatkom bakterija (Klebsiella aerogene )[3]
Slični rodovi
[uredi | uredi izvor]Jakobids (Jakobida ili Jakobea)
- Histiona: 2-3 vrste
- Reclinomonas: 1 vrsta [7]
Malawimonas: 1 opisana vrsta.
Također pogledajte
[uredi | uredi izvor]Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (august 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans". Current Biology. 17 (16): 1420–1425. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961.
- ^ a b "Jakoba libera". The Tree of Life Web Project. Arhivirano s originala, 27. 9. 2011. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ a b c d e f "Jakoba". Protist Image Database. Arhivirano s originala, 22. 9. 2006. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ a b "Jakoba libera". Encyclopedia of Life. Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ "Jakobida". The Tree of Life Web Project. Arhivirano s originala, 29. 11. 2019. Pristupljeno 10. 2. 2020.
- ^ "Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code". Pristupljeno 3. 4. 2012.
- ^ "Introduction to the jakobid flagellates". Protist Image Database. Pristupljeno 12. 4. 2012.
