data_6VYB
#
_model_server_result.job_id 9Srw8Ow4l3QwPQfuvqoYRA
_model_server_result.datetime_utc '2024-11-25 02:05:00'
_model_server_result.server_version 0.9.12
_model_server_result.query_name ligand
_model_server_result.source_id pdb-bcif
_model_server_result.entry_id 6vyb
#
_model_server_params.name atom_site
_model_server_params.value '{"auth_seq_id":1311}'
#
_entry.id 6VYB
#
_exptl.entry_id 6VYB
_exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY'
#
_entity.details ?
_entity.formula_weight 221.208
_entity.id 3
_entity.src_method man
_entity.type non-polymer
_entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
_entity.pdbx_number_of_molecules 35
_entity.pdbx_parent_entity_id .
_entity.pdbx_mutation ?
_entity.pdbx_fragment ?
_entity.pdbx_ec ?
#
_pdbx_struct_assembly.method_details ?
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3
_pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly
_pdbx_struct_assembly.id 1
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1
#
_pdbx_struct_oper_list.id 1
_pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation'
_pdbx_struct_oper_list.name 1_555
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ?
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1
_pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0
_pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0
_pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 P N N
? 3 Q N N
? 3 R N N
? 3 S N N
? 3 T N N
? 3 U N N
? 3 V N N
? 3 W N N
? 3 X N N
? 3 Y N N
? 3 Z N N
? 3 AA N N
? 3 BA N N
? 3 CA N N
? 3 DA N N
? 3 EA N N
? 3 FA N N
? 3 GA N N
? 3 HA N N
? 3 IA N N
? 3 JA N N
? 3 KA N N
? 3 LA N N
? 3 MA N N
? 3 NA N N
? 3 OA N N
? 3 PA N N
? 3 QA N N
? 3 RA N N
? 3 SA N N
? 3 TA N N
? 3 UA N N
? 3 VA N N
? 3 WA N N
? 3 XA N N
#
_pdbx_entity_branch.entity_id 2
_pdbx_entity_branch.type oligosaccharide
#
_pdbx_entity_branch_link.link_id 1
_pdbx_entity_branch_link.details ?
_pdbx_entity_branch_link.entity_id 2
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2
_pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG
_pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1
_pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 .
_pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4
_pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4
_pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 .
_pdbx_entity_branch_link.value_order sing
#
loop_
_pdbx_branch_scheme.entity_id
_pdbx_branch_scheme.hetero
_pdbx_branch_scheme.asym_id
_pdbx_branch_scheme.mon_id
_pdbx_branch_scheme.num
_pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id
_pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_branch_scheme.auth_asym_id
_pdbx_branch_scheme.auth_seq_num
_pdbx_branch_scheme.auth_mon_id
2 n D NAG 1 D 1 NAG A 1337 NAG
2 n D NAG 2 D 2 NAG A 1338 NAG
2 n E NAG 1 E 1 NAG A 1355 NAG
2 n E NAG 2 E 2 NAG A 1356 NAG
2 n F NAG 1 F 1 NAG A 1358 NAG
2 n F NAG 2 F 2 NAG A 1359 NAG
2 n G NAG 1 G 1 NAG A 1368 NAG
2 n G NAG 2 G 2 NAG A 1369 NAG
2 n H NAG 1 H 1 NAG A 1373 NAG
2 n H NAG 2 H 2 NAG A 1374 NAG
2 n I NAG 1 I 1 NAG B 1358 NAG
2 n I NAG 2 I 2 NAG B 1359 NAG
2 n J NAG 1 J 1 NAG B 1368 NAG
2 n J NAG 2 J 2 NAG B 1369 NAG
2 n K NAG 1 K 1 NAG B 1373 NAG
2 n K NAG 2 K 2 NAG B 1374 NAG
2 n L NAG 1 L 1 NAG C 1355 NAG
2 n L NAG 2 L 2 NAG C 1356 NAG
2 n M NAG 1 M 1 NAG C 1358 NAG
2 n M NAG 2 M 2 NAG C 1359 NAG
2 n N NAG 1 N 1 NAG C 1368 NAG
2 n N NAG 2 N 2 NAG C 1369 NAG
2 n O NAG 1 O 1 NAG C 1373 NAG
2 n O NAG 2 O 2 NAG C 1374 NAG
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 150 A CYS 131 1_555 A SG CYS 185 A CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ?
disulf ? disulf2 A SG CYS 310 A CYS 291 1_555 A SG CYS 320 A CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ?
disulf ? disulf3 A SG CYS 355 A CYS 336 1_555 A SG CYS 380 A CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ?
disulf ? disulf4 A SG CYS 398 A CYS 379 1_555 A SG CYS 451 A CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ?
disulf ? disulf5 A SG CYS 410 A CYS 391 1_555 A SG CYS 544 A CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ?
disulf ? disulf6 A SG CYS 557 A CYS 538 1_555 A SG CYS 609 A CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ?
disulf ? disulf7 A SG CYS 636 A CYS 617 1_555 A SG CYS 668 A CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ?
disulf ? disulf8 A SG CYS 681 A CYS 662 1_555 A SG CYS 690 A CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ?
disulf ? disulf9 A SG CYS 757 A CYS 738 1_555 A SG CYS 779 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ?
disulf ? disulf10 A SG CYS 762 A CYS 743 1_555 A SG CYS 768 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ?
disulf ? disulf11 A SG CYS 1051 A CYS 1032 1_555 A SG CYS 1062 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ?
disulf ? disulf12 A SG CYS 1101 A CYS 1082 1_555 A SG CYS 1145 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ?
disulf ? disulf13 B SG CYS 150 B CYS 131 1_555 B SG CYS 185 B CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ?
disulf ? disulf14 B SG CYS 310 B CYS 291 1_555 B SG CYS 320 B CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ?
disulf ? disulf15 B SG CYS 398 B CYS 379 1_555 B SG CYS 451 B CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ?
disulf ? disulf16 B SG CYS 410 B CYS 391 1_555 B SG CYS 544 B CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ?
disulf ? disulf17 B SG CYS 557 B CYS 538 1_555 B SG CYS 609 B CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ?
disulf ? disulf18 B SG CYS 636 B CYS 617 1_555 B SG CYS 668 B CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ?
disulf ? disulf19 B SG CYS 681 B CYS 662 1_555 B SG CYS 690 B CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ?
disulf ? disulf20 B SG CYS 757 B CYS 738 1_555 B SG CYS 779 B CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ?
disulf ? disulf21 B SG CYS 762 B CYS 743 1_555 B SG CYS 768 B CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ?
disulf ? disulf22 B SG CYS 1051 B CYS 1032 1_555 B SG CYS 1062 B CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ?
disulf ? disulf23 B SG CYS 1101 B CYS 1082 1_555 B SG CYS 1145 B CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ?
disulf ? disulf24 C SG CYS 150 C CYS 131 1_555 C SG CYS 185 C CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ?
disulf ? disulf25 C SG CYS 310 C CYS 291 1_555 C SG CYS 320 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ?
disulf ? disulf26 C SG CYS 355 C CYS 336 1_555 C SG CYS 380 C CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ?
disulf ? disulf27 C SG CYS 398 C CYS 379 1_555 C SG CYS 451 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ?
disulf ? disulf28 C SG CYS 410 C CYS 391 1_555 C SG CYS 544 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ?
disulf ? disulf29 C SG CYS 557 C CYS 538 1_555 C SG CYS 609 C CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ?
disulf ? disulf30 C SG CYS 636 C CYS 617 1_555 C SG CYS 668 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ?
disulf ? disulf31 C SG CYS 681 C CYS 662 1_555 C SG CYS 690 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ?
disulf ? disulf32 C SG CYS 757 C CYS 738 1_555 C SG CYS 779 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ?
disulf ? disulf33 C SG CYS 762 C CYS 743 1_555 C SG CYS 768 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ?
disulf ? disulf34 C SG CYS 1051 C CYS 1032 1_555 C SG CYS 1062 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ?
disulf ? disulf35 C SG CYS 1101 C CYS 1082 1_555 C SG CYS 1145 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ?
covale ? covale1 A ND2 ASN 80 A ASN 61 1_555 P C1 NAG . A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ?
covale ? covale2 A ND2 ASN 141 A ASN 122 1_555 Q C1 NAG . A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale3 A ND2 ASN 253 A ASN 234 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale4 A ND2 ASN 301 A ASN 282 1_555 R C1 NAG . A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ?
covale ? covale5 A ND2 ASN 350 A ASN 331 1_555 S C1 NAG . A NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.515 ?
covale ? covale6 A ND2 ASN 362 A ASN 343 1_555 T C1 NAG . A NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale7 A ND2 ASN 622 A ASN 603 1_555 U C1 NAG . A NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ?
covale ? covale8 A ND2 ASN 635 A ASN 616 1_555 V C1 NAG . A NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale9 A ND2 ASN 676 A ASN 657 1_555 W C1 NAG . A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ?
covale ? covale10 A ND2 ASN 728 A ASN 709 1_555 X C1 NAG . A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ?
covale ? covale11 A ND2 ASN 736 A ASN 717 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale12 A ND2 ASN 820 A ASN 801 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale13 A ND2 ASN 1093 A ASN 1074 1_555 Y C1 NAG . A NAG 1316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ?
covale ? covale14 A ND2 ASN 1117 A ASN 1098 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ?
covale ? covale15 A ND2 ASN 1153 A ASN 1134 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale16 B ND2 ASN 80 B ASN 61 1_555 Z C1 NAG . B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ?
covale ? covale17 B ND2 ASN 141 B ASN 122 1_555 AA C1 NAG . B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ?
covale ? covale18 B ND2 ASN 184 B ASN 165 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale19 B ND2 ASN 253 B ASN 234 1_555 BA C1 NAG . B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ?
covale ? covale20 B ND2 ASN 301 B ASN 282 1_555 CA C1 NAG . B NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale21 B ND2 ASN 350 B ASN 331 1_555 DA C1 NAG . B NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale22 B ND2 ASN 362 B ASN 343 1_555 EA C1 NAG . B NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.54 ?
covale ? covale23 B ND2 ASN 622 B ASN 603 1_555 FA C1 NAG . B NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale24 B ND2 ASN 635 B ASN 616 1_555 GA C1 NAG . B NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale25 B ND2 ASN 676 B ASN 657 1_555 HA C1 NAG . B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.51 ?
covale ? covale26 B ND2 ASN 728 B ASN 709 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ?
covale ? covale27 B ND2 ASN 736 B ASN 717 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ?
covale ? covale28 B ND2 ASN 820 B ASN 801 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale29 B ND2 ASN 1093 B ASN 1074 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale30 B ND2 ASN 1117 B ASN 1098 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale31 B ND2 ASN 1153 B ASN 1134 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ?
covale ? covale32 C ND2 ASN 80 C ASN 61 1_555 MA C1 NAG . C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale33 C ND2 ASN 141 C ASN 122 1_555 NA C1 NAG . C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ?
covale ? covale34 C ND2 ASN 184 C ASN 165 1_555 XA C1 NAG . C NAG 1320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.506 ?
covale ? covale35 C ND2 ASN 253 C ASN 234 1_555 OA C1 NAG . C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ?
covale ? covale36 C ND2 ASN 301 C ASN 282 1_555 PA C1 NAG . C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale37 C ND2 ASN 350 C ASN 331 1_555 QA C1 NAG . C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ?
covale ? covale38 C ND2 ASN 362 C ASN 343 1_555 RA C1 NAG . C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale39 C ND2 ASN 622 C ASN 603 1_555 SA C1 NAG . C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale40 C ND2 ASN 635 C ASN 616 1_555 TA C1 NAG . C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ?
covale ? covale41 C ND2 ASN 676 C ASN 657 1_555 UA C1 NAG . C NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.512 ?
covale ? covale42 C ND2 ASN 728 C ASN 709 1_555 VA C1 NAG . C NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale43 C ND2 ASN 736 C ASN 717 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale44 C ND2 ASN 820 C ASN 801 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ?
covale ? covale45 C ND2 ASN 1093 C ASN 1074 1_555 WA C1 NAG . C NAG 1315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale46 C ND2 ASN 1117 C ASN 1098 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale47 C ND2 ASN 1153 C ASN 1134 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.498 ?
covale ? covale48 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ?
covale ? covale49 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale50 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ?
covale ? covale51 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.503 ?
covale ? covale52 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.514 ?
covale ? covale53 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ?
covale ? covale54 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ?
covale ? covale55 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ?
covale ? covale56 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ?
covale ? covale57 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ?
covale ? covale58 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ?
covale ? covale59 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.511 ?
#
_chem_comp.formula 'C8 H15 N O6'
_chem_comp.formula_weight 221.208
_chem_comp.id NAG
_chem_comp.mon_nstd_flag .
_chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
_chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking'
_chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 NAG sing 235 n n
C1 O1 NAG sing 236 n n
C1 O5 NAG sing 237 n n
C1 H1 NAG sing 238 n n
C2 C3 NAG sing 239 n n
C2 N2 NAG sing 240 n n
C2 H2 NAG sing 241 n n
C3 C4 NAG sing 242 n n
C3 O3 NAG sing 243 n n
C3 H3 NAG sing 244 n n
C4 C5 NAG sing 245 n n
C4 O4 NAG sing 246 n n
C4 H4 NAG sing 247 n n
C5 C6 NAG sing 248 n n
C5 O5 NAG sing 249 n n
C5 H5 NAG sing 250 n n
C6 O6 NAG sing 251 n n
C6 H61 NAG sing 252 n n
C6 H62 NAG sing 253 n n
C7 C8 NAG sing 254 n n
C7 N2 NAG sing 255 n n
C7 O7 NAG doub 256 n n
C8 H81 NAG sing 257 n n
C8 H82 NAG sing 258 n n
C8 H83 NAG sing 259 n n
N2 HN2 NAG sing 260 n n
O1 HO1 NAG sing 261 n n
O3 HO3 NAG sing 262 n n
O4 HO4 NAG sing 263 n n
O6 HO6 NAG sing 264 n n
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1
NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1
NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1
NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1
#
_atom_sites.entry_id 6VYB
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1
_atom_sites.fract_transf_vector[1] 0
_atom_sites.fract_transf_vector[2] 0
_atom_sites.fract_transf_vector[3] 0
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
P 3 NAG A 1 1301 1329 NAG NAG .
Q 3 NAG A 1 1302 1334 NAG NAG .
R 3 NAG A 1 1305 1339 NAG NAG .
S 3 NAG A 1 1306 1342 NAG NAG .
T 3 NAG A 1 1307 1343 NAG NAG .
U 3 NAG A 1 1308 1346 NAG NAG .
V 3 NAG A 1 1309 1347 NAG NAG .
W 3 NAG A 1 1310 1348 NAG NAG .
X 3 NAG A 1 1311 1350 NAG NAG .
Y 3 NAG A 1 1316 1363 NAG NAG .
Z 3 NAG B 1 1301 1329 NAG NAG .
AA 3 NAG B 1 1302 1334 NAG NAG .
BA 3 NAG B 1 1303 1337 NAG NAG .
CA 3 NAG B 1 1304 1339 NAG NAG .
DA 3 NAG B 1 1305 1342 NAG NAG .
EA 3 NAG B 1 1306 1343 NAG NAG .
FA 3 NAG B 1 1307 1346 NAG NAG .
GA 3 NAG B 1 1308 1347 NAG NAG .
HA 3 NAG B 1 1309 1348 NAG NAG .
IA 3 NAG B 1 1310 1350 NAG NAG .
JA 3 NAG B 1 1311 1355 NAG NAG .
KA 3 NAG B 1 1314 1363 NAG NAG .
LA 3 NAG B 1 1319 1401 NAG NAG .
MA 3 NAG C 1 1301 1329 NAG NAG .
NA 3 NAG C 1 1302 1334 NAG NAG .
OA 3 NAG C 1 1303 1337 NAG NAG .
PA 3 NAG C 1 1304 1339 NAG NAG .
QA 3 NAG C 1 1305 1342 NAG NAG .
RA 3 NAG C 1 1306 1343 NAG NAG .
SA 3 NAG C 1 1307 1346 NAG NAG .
TA 3 NAG C 1 1308 1347 NAG NAG .
UA 3 NAG C 1 1309 1348 NAG NAG .
VA 3 NAG C 1 1310 1350 NAG NAG .
WA 3 NAG C 1 1315 1363 NAG NAG .
XA 3 NAG C 1 1320 1401 NAG NAG .
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 NAG . . . X 3 182.372 206.869 147.335 1 23.69 ? C1 NAG 1311 A 1
HETATM 2 C C2 NAG . . . X 3 182.625 205.871 146.143 1 23.82 ? C2 NAG 1311 A 1
HETATM 3 C C3 NAG . . . X 3 181.476 206.037 145.115 1 23.87 ? C3 NAG 1311 A 1
HETATM 4 C C4 NAG . . . X 3 180.121 205.753 145.816 1 24.09 ? C4 NAG 1311 A 1
HETATM 5 C C5 NAG . . . X 3 179.948 206.745 147.003 1 23.91 ? C5 NAG 1311 A 1
HETATM 6 C C6 NAG . . . X 3 178.659 206.502 147.778 1 24.66 ? C6 NAG 1311 A 1
HETATM 7 C C7 NAG . . . X 3 185.075 205.62 145.871 1 23.8 ? C7 NAG 1311 A 1
HETATM 8 C C8 NAG . . . X 3 186.313 206.088 145.169 1 24.14 ? C8 NAG 1311 A 1
HETATM 9 N N2 NAG . . . X 3 183.925 206.202 145.537 1 23.72 ? N2 NAG 1311 A 1
HETATM 10 O O3 NAG . . . X 3 181.669 205.11 144.035 1 24.1 ? O3 NAG 1311 A 1
HETATM 11 O O4 NAG . . . X 3 179.064 205.923 144.875 1 24.29 ? O4 NAG 1311 A 1
HETATM 12 O O5 NAG . . . X 3 181.078 206.588 147.945 1 23.66 ? O5 NAG 1311 A 1
HETATM 13 O O6 NAG . . . X 3 178.311 207.633 148.571 1 24.17 ? O6 NAG 1311 A 1
HETATM 14 O O7 NAG . . . X 3 185.126 204.731 146.73 1 23.36 ? O7 NAG 1311 A 1
#
_model_server_stats.io_time_ms 17
_model_server_stats.parse_time_ms 9
_model_server_stats.create_model_time_ms 20
_model_server_stats.query_time_ms 277
_model_server_stats.encode_time_ms 5
_model_server_stats.element_count 14
#